細菌室常規檢測項目：
一 、形態學檢查（Morphological Examination）
（一）各種染色
1、革蘭染色（Gram stain）：將細菌分為革蘭陽性菌如葡萄球菌屬，鏈球菌屬等；革蘭陰性菌如大腸埃希菌沙門菌，志賀菌等。
2、抗酸染色(Acid-fast stain)：通過染色將細菌分為兩大類：抗酸性細菌和非抗酸性細菌，抗酸性細菌種類較少，如結核分枝桿菌，麻風分枝桿菌等。正常：未見?？顾崛旧业郊t色分枝桿菌，及報告“找見抗酸分枝桿菌”，量可以用加號表示：
++++ 每個視野>10根
+++ 每個視野發現1～10根
++ 100個視野發現10～99根
+ 300個視野發現3～9根
± 300個視野發現1～2根
3、異染顆粒染色（Metachromatic granula stain）：用于檢查棒狀桿菌。
4、墨汁染色（Indian ink negative staining）：用背景著色，而細菌本身不著色的染色方法，用于腦脊液中查找新生隱球菌。正常：未見。
5、鞭毛染色（Flagella stain）：鞭毛的數目和位置隨細菌種類而不同，可分為周毛菌、單毛菌、雙毛菌和叢毛菌，是細菌分類和鑒定的重要依據。如霍亂弧菌是單鞭毛菌。
6、莢膜染色（Capsules stain）：莢膜是細菌壁外一層粘液性多聚物，賦予致病菌的侵襲力。染色將莢膜染成與菌體不同顏色，可作為細菌鑒定的依據。如肺炎鏈球菌。
（二）涂片檢測(smear)
1、便球桿比檢查( stool cocus/bacillus)：即革蘭陽性球菌與革蘭陰性桿菌之比。
正常值：便球桿比：1:3
臨床意義：健康人腸道內寄居著大量厭氧菌和小部分需氧菌。除人乳喂養的嬰兒腸道內以革蘭陽性球菌為主外，其余人均以革蘭陰性桿菌占優勢。在腸道發生致病菌如沙門、志賀、弧菌感染時往往由于使用抗生素而是革蘭陰性桿菌受到抑制，此時球菌/桿菌比值有可能變大。若比值顯著增大，常提示腸道菌群紊亂或發生二重感染。
2、標本真菌涂片（fungi）：經革蘭染色如發現革蘭陽性卵圓形芽生孢子或假菌絲，可初步報告為：找到真菌孢子和菌絲。
正常值：未見真菌。
3、痰涂片檢查（sputum smear）：
臨床意義：目的確定標本是否適合做細菌培養，初步判定是否有致病菌存在。首先應確定標本是否為來自下呼吸道的痰，其標準為革蘭染色WBC>25/LPF(低倍視野),上皮細胞<10/LPF。有些細菌可做初步判斷：
1) 肺炎鏈球菌：革蘭染色為陽性球菌，成雙或短鏈狀排列
2) 結核分枝桿菌：抗酸染色，找到紅色分枝桿菌，及報告“找見抗酸分枝桿菌”，量可以用加號表示：
++++ 每個視野>10根
+++ 每個視野發現1～10根
++ 100個視野發現10～99根
+ 300個視野發現3～9根
± 300個視野發現1～2根
3) 真菌：經革蘭染色如發現革蘭陽性卵圓形芽生孢子或假菌絲，可初步報告為：找到真菌孢子和菌絲。
4) 放線菌及奴卡菌：革蘭染色后，插件中央部分菌絲為革蘭陽性，而四周放射的末梢菌絲為革蘭陰性，切部分菌株有抗酸性?？蓤蟾妫赫乙娨伤品啪€菌或奴卡菌。
二 、細菌分離培養（Isolation and Culture of bacteria）
1、血培養 (blood culture)：
臨床意義：正常人體的血液是無菌的,當人體局部感染向全身播散和出現全身感染時,血液中可出現細菌,依據程度不同稱為菌血癥或敗血癥.菌血癥往往需要以多次血培養證實,如表皮葡萄球菌,即可是致病菌,也是較常見的污染菌.
正常：無菌生長。zui終陰性報告時間為7天。亞急性心內膜炎患者標本如5～6天無菌生長，應繼續培養至2周方可報告陰性結果。布魯氏菌培養第3周做出zui終陰性報告。厭氧菌培養應在第2周做出zui終陰性報告。真菌血癥應在第3周做出zui終陰性報告。結核血培養應在第6周做出zui終陰性報告。
2、尿液培養（urine culture）：
臨床意義：正常人體膀胱中的尿液是無菌的，用膀胱穿刺取出的尿液應是無菌的。當尿液經尿道排出體外，受到尿道中細菌的污染而混有細菌。取經尿道排出的中斷尿，細菌數不會超過104-5ml，因而，以此界限作為診斷泌尿道系感染的依據。
尿液培養反映腎臟、尿道、前列腺等的炎癥變化，幫助臨床選擇有效抗菌藥物。正常48小時仍無菌生長可做zui終陰性報告。24小時如有細菌生長即做細菌鑒定及藥敏。
3、痰培養：（sputum culture）：
臨床意義：痰中的病原菌不少屬于機會致病菌，與正常菌群同在，在報告時應做說明。對于機會致病菌，一般僅當其數量超過正常菌群時才可報告鑒定結果及藥敏試驗結果。
檢出致病菌時，除報告該菌的鑒定名稱外，還需同時報告正常菌群情況。通常以報告甲型鏈球菌和奈瑟氏菌作為正常菌群存在的指標。
如：甲型鏈球菌+
奈瑟氏菌 +
肺炎克雷伯氏菌2+
此報告表明肺炎克雷伯氏菌在數量上多于正常菌群，診斷為病原菌。未檢出致病菌時，應報告“正常菌群”。
4、咽拭子培養（pharynx swab culture）：
臨床意義：鼻、咽部的細菌感染病原菌源于口腔，口腔中既有需氧菌，也有厭氧菌。同痰培養一樣，病原菌不少屬于機會致病菌，與正常菌群同在，要正確區分。未檢出致病菌時，應報告“正常菌群”。
5、穿刺液標本（包括胸腹水、關節液、心包液）的培養（Serous Cavity Effusion culture）：
臨床意義:正常的穿刺液是無菌的，有感染的情況下，只要檢出細菌，通常都可視為是病原菌。正常：無菌生長。
6、糞便培養（stool culture）：
臨床意義：一方面從腸道大量細菌中找出致病菌，對腸道疾病進行病原學診斷并通過藥敏試驗為臨床提供合適的用藥；另一方面可對腸道菌群進行監測，在疾病治療中預防菌群紊亂。正常：未檢出致病菌。
7、腦脊液培養(CSF culture)：
臨床意義：正常人體腦脊液是無菌的。
當人體患有腦脊髓膜炎時,在腦脊髓液中可以出現病原菌。常見的病原菌有細菌、真菌和結核菌等。正常：無菌生長。
8、化膿及創傷感染標本的培養（Purulent Secretion Culture）:
臨床意義：組織或器官的化膿性感染,其病原菌的來源可以分為兩類；
內源性:感染源是炎癥局部周圍的器官中的正常菌群(常在菌群),由于損傷等因素造成常在菌群進入無菌狀態的組織內,發生感染.
外源性:感染源是存在于人體外部自然界的微生物,由于外傷和直接接觸,外界微生物通過人體表面進入人體,造成感染.
常見細菌有*、鏈球菌、消化鏈球菌；陽性桿菌有炭疽芽孢桿菌、破傷風梭菌、產氣莢膜梭菌、潰瘍棒狀桿菌；陰性桿菌有腸桿菌、嗜血桿菌、產堿桿菌、假單胞菌、無色桿菌、擬桿菌、弧菌、氣單胞菌；其他有放線菌、奴卡氏菌、念珠菌、結核分枝桿菌。
三、手工試驗
1、觸酶試驗(catalase test)：具有觸酶（過氧化氫酶）的細菌，能催化過氧化氫，放出新生態氧，繼而生成分子氧出現氣泡。
2、凝固酶試驗（coagulase test）：*產生的結合凝固酶，結合在細胞壁上，使血漿中的纖維蛋白原變成纖維蛋白附著于細菌表面，發生凝集反應。
3 、CAMP試驗：B群鏈球菌具有“CAMP”因子，能促進葡萄球菌β溶血素的活性，使兩種細菌在劃線處呈現箭頭形透明溶血區。
4 、Optochin敏感試驗：Optochin（ethylhydrocupreine，乙基氫化去甲奎寧的商品名）可干擾肺炎鏈球菌*的生物合成，抑制該菌的生長，故肺炎鏈球菌對其敏感，其他鏈球菌對其耐藥。
5、氧化酶試驗( oxidase test): 該試紙條適用于G-桿菌的氧化酶實驗。具有氧化酶的細菌，首先使*氧化，再由氧化型*使鹽酸對二甲氨基苯胺氧化，并與α萘酚結合，生成靛酚藍而成藍色。用于初步判斷奈瑟氏菌屬及腸桿菌科的非發酵菌。
6、超廣譜β-內酰胺酶的測定（ESBLS檢測）:有些大腸和肺克能產生超廣譜β-內酰胺酶，他不僅能水解*代和第二代*，還能水解第三代*類抗生素，如*、*等和單酰胺酶，使其失去抗菌作用，但對碳青霉烯類無明顯作用。
7、 MRSA和MRS檢測：用30ug紙片的*的藥敏結果及新的折點能預測mecA介導的耐藥。
8 、D－試驗：大環內脂類耐藥的葡萄球菌可以改變、誘導*耐藥 。由erm基因導致 23S rRNA 甲基化耐藥，與大環內脂類, *, 和 * B型有交叉，又叫 MLSB 耐藥，或只耐大環內脂類 (msrA 基因編碼的泵出機制 )
四、血清學檢測
1、肥達氏反應（Widal）：
正常值：H：<1：80； O：1<：80； 甲：<1：80； 乙：<1：80；丙：<1：80
臨床意義：用標準傷寒、副傷寒菌液與稀釋的待檢測血清反應，根據凝集效價判定血清中有無抗傷寒或抗副傷寒桿菌的抗體。在病程的不同時期相隔5-7天，連續進行血清學檢查，如果血清滴度隨之增高4倍或4倍以上就更有診斷價值。
2、外斐氏反應(Weil-Felix)：
正常值：OX19：<1：80 ；OXK： <1：80
臨床意義：用與立克次氏體有共同的抗原成分的變形桿菌X19、X2、Xk菌株的O抗原與被檢血清作交叉凝集反應，借以診斷斑疹傷寒、恙蟲病等立克次氏體病。一般認為凝集價>1：80即有診斷意義.更為重要的是此種試驗的凝集滴度隨病程發展而很快上升(在發病兩周末可升高數倍),到恢復后期又明顯下降。
3、結核抗體的檢測(TB-CHECK-1)
正常值：陰性
臨床意義：快速、定性的過篩試驗，能特異性地檢測出活動性結核病人血清、血漿或全血中的抗結核桿菌抗體。主要檢測IgG和IgA，高濃度的IgM亦可被檢出。接種過疫苗的人體試驗不起反應。
4、支原體培養 （解脲支原體UU或人型支原體MH）
正常值：陰性
臨床意義：現已從人類泌尿生殖道分離出來7種支原體，其中分離率較高而與泌尿生殖道疾病有關，是解脲支原體，其次是人型支原體。人型支原體（M.humenis，MH）、解脲支原體（Ureaplasma urealyticum，UU）和生殖器支原體（M.genitalium，MG）都會引起泌尿生殖道感染。UU與新生兒疾病與成人泌尿生殖道系統炎癥疾病有關，傳播途徑為性接觸和母嬰接觸，因此UU感染列為性傳播疾病常引起非淋菌性尿道炎，慢性前列腺炎和附睪炎，不育不孕，染等。MH主要引起泌尿生殖系統感染包，急性腎盂腎炎，及宮頸炎等。在健康人群中，可能有U.u或M.h寄生，但<103CCU/ml，故本試劑盒檢測結果為陰性。檢測到≥104CCU/ml 的 U.u或M.h有較明確臨床意義，一般需用藥治療。103～104CCU/ml的 U.u或M.h，提示支原體輕度感染，供醫生診斷治療時參考。
7、革蘭陰性菌脂多糖（LPS）檢測：體液內毒素測定（鱟試驗）
正常范圍：<10Pg/ml
臨床意義：細菌內毒素作為革蘭陰性菌細胞壁zui外層結構之一,具有多種生物效應，微量內毒素進入機體后,將會產生發燒、休克及內毒素血癥等臨床癥狀。以鱟實驗來檢測內毒素，能對內毒素血癥、革蘭氏陰性細菌敗血癥和革蘭氏陰性細菌感染的病人做出早期診斷和治療。
8、真菌（1-3）-β-D-葡聚糖檢測(G試驗)
正常范圍：<10Pg/ml
臨床意義：所有真菌的細胞壁上都含有（1-3）-β-D-葡聚糖，而其他微生物、動物及人的細胞成分和細胞外液都不含這種成分，因此在機體的體液中檢測到（1-3）-β-D-葡聚糖時診斷侵襲性真菌感染的有效依據。
9、嗜異性凝集檢試驗：
正常值：陰性或凝集價<1：8
臨床意義：傳染性單核細胞增多癥的病原體是EB病毒，病人血清中可測到嗜異性凝集和抗EB病毒的抗體，此試驗可診斷此病。凝集價有較大增高見于：血清病、何杰金氏病和日本血吸蟲感染的急性期。 當凝集價達到1：224以上時可結合病人臨床癥狀確診為傳染性單核細胞增多癥。約10%的病人試驗為陰性，以兒童和嬰兒為主。
10、布氏桿菌凝集試驗（Bacterium burgeri agglutination test）：
正常值：陰性
臨床意義：是應用已知菌株檢測血清中特異性抗體，目前仍是標準診斷布氏病的血清學方法。感染2周后陽性率可達90%，3～5周時，效價zui高，1：160以上有診斷意義，動態觀察升高4倍以上更有意義。其對人體感染的陽性檢出率為：急性期為94.85%；亞急性期為87.50%；慢性期為61.11%。隨著病程的延長和康復,血清中特異性抗體效價逐漸降低，但亦有持續價達數年之久。影響該實驗的因素除影響抗原抗體反應常見因素外,嚴格掌握診斷菌的濃度十分重要.診斷菌液的濃度越大,敏感性越低,反之敏感性提高。另外，某些細菌感染，如傷寒、霍亂等可有交叉反應。
11、新型隱球菌抗原檢測（Cryptococcus neoformans antigen detect）
臨床意義：定性和半定量檢測新型隱球菌在血清和腦脊髓液中的莢膜多聚糖抗原。 隱球菌抗原經常存在于肺部隱球菌病人的血清中以及中樞神經系統病人的血清和腦 脊液中?，F在所有隱球菌病例中幾乎50%是發生在HIV陽性患者身上。除了AIDS患 者之外，隱球菌還會很罕見的發生在普通人身上，以及由于有紅斑狼瘡、肉樣瘤病、白血病、淋巴瘤、庫欣病等潛在疾病或因皮質激素、細胞毒素藥物和移植實驗等抑制性治療而消弱免疫系統的人身上。
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